Très aromatique, le génépi noir se caractérise par une tige courte et des étoiles noirâtres sur le calice qui lui donnent son nom. Le plant est plus petit que le génépi jaune. Il pousse à haute altitude (entre 2200 et 3500m), essentiellement dans les rochers, les éboulis et les moraines glaciaires. Il fleurit de mi-juin à août, chaque plant ne comptant que cinq ou six fleurs, contre près d'une trentaine pour le génépi jaune. Il fut très utilisé en France dans les régions montagneuses jusqu’au début du XXème siècle, que ce soit en macération dans l’eau de vie ou en tisane. Sa rareté et son faible rendement expliquent qu'il ne soit pratiquement plus utilisé dans l'élaboration des liqueurs de plantes.
C’est Jean-Jacques Rousseau qui introduit le nom de génépi dans la langue française dans un récit des Confessions (I, V) qui relate la mort de Claude Anet, Rousseau s’étonnant que le génépi ne puisse le sauver de la pleurésie.
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